深圳市南方民营科技研究院是根据国务院办公厅国办发『2000』78号文件规定进行运行及接受管理，属于非营利性科研事业的机构，遵循国家科技部、深圳市科技和信息局的业务指导，主要在南方地区开展民营科技有关研究工作，为各级政府及企业服务。

深圳市南方民营科技研究院的主要特点是为政府部门和科技企业二头服务。研究院由中共中央办公厅调研室研究员、原副主任、科教组组长、党委书记于维栋同志为首等一批长期从事我国科技政策研究的专家倡导成立，主要优势在于其强大的智囊专家领导团队开展理论研究工作，充分的发挥了专家资源优势。便于开展高端的理论研究工作，并长期参与部委的研究。通过广泛、不断到科技园区、企业园区和科技企业进行调研，深知科技园区、企业园区及科技企业的真实情况和实际需求，对参与及协助政府部门从事政策咨询和服务科技企业效果显著。